1Aセメスターで必修科目を落としてしまった2年生なのですが、この場合落単した科目は、進振りにはどのように加算されるのでしょうか？

その落とした科目が何かによって変わりますが、基本的には、1Aでの必修の落単はその点数のまま重率1で基本平均点に算入されるので大損です。 必修（実質的な必修も含む）でも、英語中級や社会科学（文科生）なら、追い出しの余地があります。