試験の大半が終わった今、高得点を取ったところでいいことあるのか？と思ったのですが、高得点を取るメリットって進振り系以外に何かありますか？

一定の基準を満たせばCAP制が外れるので履修できる単位数が無限になります。また、奨学金申請の際に選考で有利になったり、等々。学科によっては研振りやコース振りで3，4年次に響くことも。