追い出し前提なら49不可よりも50可のほうが結果的には基本平均点が高くなりますよね？

そうですね、再履修をしないのであれば、1点でも高いほうが、最終的な基本平均点は高くなります。ただ1点の違いが基本平均点に及ぼす影響は微々たるものですが…50点とか違うと顕著な（といっても0.2点とかそんな感じの）差として現れて来るでしょう。