新2年の者です。総合科目を1年生で欠席し、2Sで取り直すときは科目名が同じであれば、先生は欠席した時の先生と違っていてもよろしいのでしょうか？

その認識で大丈夫だと思います。もし不安であれば教務課に確認してください。また、L系列の再履修については注意点があります。もしL系列の再履修をご検討でしたら、https://note.com/ut_base/n/nc7530e1f0f6eをお読みください。