夏休みの集中講義の主題科目を2Sに履修した場合ってって進振りの際にカウントされますか？農学部やシス創第二段階などの単位数×平均点で判定するような学科の場合です

夏休み中の集中講義はまずカウントされないでしょうね。。。進振りの時点で成績が発表されていることが条件です。農学部第一段階第三段階指定平均点やシス創第二段階指定平均点は、単位を修得した＝合格したものに限ります。