総合科目の追い出しってとった順に同じ科目の点数の高いやつから採用されるってことですか？例えば総合科目Aが4単位必要だと仮定して、Aから10単位取ったらそのうち上から4つが成績になるってことですか？

その通りです。自動的に点数が高いものが優先的に計算されます。ただし、「2系列以上にわたり」などの条件(『履修の手引き』9ページ)も考慮されて計算されるので、必ずしも得点順にならないときがあります。