主題科目は2Aに回しても大丈夫ですよね？

そうですね。主題科目の単位取得は、2Sまでに満たすべき進振り参加要件には含まれないので、2Aで無事取得できれば問題ありません。ただし、前期課程修了要件には含まれるので、もし2Aで主題科目を落としてしまうと、留年が確定してしまいます。リスクヘッジのためにも、2Sまでに主題科目を取る方が多いです。