理2です。理系のくせに総合科目F系列に興味がある授業がほぼなく、準必修の図形科学Aとアルゴリズム入門を取らずにいこうと思っています。このままいくとF系列は基礎統計の2単位だけしかないことになりそうなのですが、E系列で複数授業をとれば進学選択が可能となる条件や前期課程修了要件は満たすことができるので問題ないという認識でいます。これでなにか問題ありますか？

大丈夫です。理2ということで，その場合はFの基礎統計（2単位）と，Eの中から最低4単位をとる必要があります。