理科から後期文系への進学を考えています。仮に進振りに成功したとしても、前期文科の基礎科目など履修していない科目が発生してしまうと思いますが、独学すべきでしょうか？

学部によると思います。法学部などは、今までに法や政治の授業に触れていることを前提に（とまではいかなくともまあ知ってるでしょ復習しておいてね的な感じに）進むものもあります。余裕があるのであれば、勉強しておくことをお勧めします。